Conda Cheatsheet - Parameter Baris Perintah Anaconda

Lupa parameter perintah conda?

Konten Halaman

Berikut adalah sebuah Kartu Panduan Conda yang telah saya susun beberapa waktu lalu, mencakup perintah-perintah dan tips penting untuk mengelola lingkungan, paket, dan saluran yang saya temukan berguna.

Conda yang sedang tidur

Menginstal dan Memperbarui Conda

Verifikasi Instalasi dan Versi Conda:
```
conda info
```
Perbarui Conda:
```
conda update conda
```
Perbarui Meta Paket Anaconda:
```
conda update anaconda
```

Mengelola Lingkungan

Buat Lingkungan Baru:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Tentukan versi Python
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # Buat dengan paket spesifik

Aktifkan Lingkungan:

conda activate my_env  # Di Windows, Linux, macOS
source activate my_env  # Di Linux, OS X (sintaks lama)

Nonaktifkan Lingkungan:
```
conda deactivate
```
Daftar Semua Lingkungan:
```
conda env list
conda info --envs
```

Salin Lingkungan:

conda create --clone old_env --name new_env

Ubah Nama Lingkungan:
```
conda env rename -n old_env -d new_env
```

Hapus Lingkungan:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

Daftar Revisi Lingkungan:
```
conda list --revisions
```

Kembalikan Lingkungan ke Revisi:

conda install --rev 3  # Kembali ke revisi 3

Mengelola Paket

Daftar Paket yang Terinstal:

conda list
conda list -n my_env  # Daftar paket dalam lingkungan spesifik

Instal Paket:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # Instal dari saluran spesifik
conda install package_name=1.2.3  # Instal versi spesifik

Perbarui Semua Paket dalam Lingkungan:
```
conda update --all
```

Hapus Paket:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # Hapus dari lingkungan spesifik

Cari Paket:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # Cari dalam saluran spesifik

Bekerja dengan Saluran

Daftar Saluran:
```
conda config --show channels
```

Tambahkan Saluran:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # Tambahkan dengan prioritas tertinggi
conda config --append channels bioconda  # Tambahkan dengan prioritas terendah

Atur Prioritas Saluran:

conda config --set channel_priority strict

Mengeksport dan Mengimpor Lingkungan

Ekspor Lingkungan ke YAML:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # Ekspor hanya paket yang secara eksplisit diminta

Impor Lingkungan dari YAML:

conda env create --name my_env --file environment.yml

Ekspor Lingkungan ke File TEXT:
```
conda list --export > requirements.txt
```

Impor Lingkungan dari File TEXT:

conda create --name my_env --file requirements.txt

Perintah Tambahan

Dapatkan Bantuan untuk Perintah:
```
conda -h
conda install -h
```
Bersihkan File yang Tidak Digunakan:
```
conda clean --all
```

Periksa Konfigurasi Conda:

conda config --get
conda config --get channels

Mamba (Opsional)

Mamba adalah alternatif yang lebih cepat dari Conda, tetapi memiliki beberapa keterbatasan, terutama mengenai revisi lingkungan.

Instal Mamba:
```
conda install -c conda-forge mamba
```
Gunakan Mamba Secara Interchangeable dengan Conda: Sebagian besar perintah sama, tetapi Mamba tidak mendukung mengembalikan revisi lingkungan[2][4].

Tips

Buat Nama Lingkungan yang Deskriptif: Membantu dalam mengelola beberapa lingkungan.
Aktifkan Lingkungan Sebelum Menginstal Paket: Memastikan paket terinstal di lingkungan yang benar.
Gunakan Saluran Spesifik untuk Paket: Memastikan Anda mendapatkan paket dari sumber yang diinginkan.
Hindari Konflik Ketergantungan: Instal semua program dalam lingkungan secara bersamaan[5].