Folha de Dicas do Conda - Parâmetros da Linha de Comando do Anaconda - principais comandos do conda

Esqueceu os parâmetros dos comandos do conda?

Conteúdo da página

Aqui está um Conda Cheatsheet que compilei há algum tempo… Este Conda Cheatsheet abrange os comandos e dicas mais essenciais para gerenciar ambientes, pacotes e canais que encontrei úteis.

Conda dormindo

Dê uma olhada no uv - Novo Gerenciador de Pacotes, Projetos e Ambientes Python

Instalando e Atualizando Conda

Verifique a instalação e a versão do Conda:
```
conda info
```
Atualize o Conda:
```
conda update conda
```
Atualize o pacote meta Anaconda:
```
conda update anaconda
```

Gerenciando Ambientes

Crie um novo ambiente:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Especifique a versão do Python
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # Crie com pacotes específicos

Ative um ambiente:

conda activate my_env  # Em Windows, Linux, macOS
source activate my_env  # Em Linux, OS X (sintaxe mais antiga)

Desative um ambiente:
```
conda deactivate
```
Liste todos os ambientes:
```
conda env list
conda info --envs
```

Clone um ambiente:

conda create --clone old_env --name new_env

Renomeie um ambiente:
```
conda env rename -n old_env -d new_env
```

Exclua um ambiente:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

Liste as revisões de um ambiente:
```
conda list --revisions
```

Restaure um ambiente para uma revisão:

conda install --rev 3  # Volte para a revisão 3

Gerenciando Pacotes

Liste os pacotes instalados:

conda list
conda list -n my_env  # Liste os pacotes em um ambiente específico

Instale um pacote:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # Instale de um canal específico
conda install package_name=1.2.3  # Instale uma versão específica

Atualize todos os pacotes em um ambiente:
```
conda update --all
```

Desinstale um pacote:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # Desinstale de um ambiente específico

Procure por pacotes:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # Procure em um canal específico

Trabalhando com Canais

Liste os canais:
```
conda config --show channels
```

Adicione um canal:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # Adicione com prioridade mais alta
conda config --append channels bioconda  # Adicione com prioridade mais baixa

Defina a prioridade dos canais:

conda config --set channel_priority strict

Exportando e Importando Ambientes

Exporte o ambiente para YAML:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # Exporte apenas os pacotes especificamente solicitados

Importe o ambiente a partir de YAML:

conda env create --name my_env --file environment.yml

Exporte o ambiente para um arquivo de texto:
```
conda list --export > requirements.txt
```

Importe o ambiente a partir de um arquivo de texto:

conda create --name my_env --file requirements.txt

Comandos Adicionais

Obtenha ajuda para um comando:
```
conda -h
conda install -h
```
Limpe arquivos não utilizados:
```
conda clean --all
```

Examine a configuração do Conda:

conda config --get
conda config --get channels

Mamba (Opcional)

Mamba é uma alternativa mais rápida ao Conda, mas tem algumas limitações, especialmente em relação a revisões de ambientes.

Instale o Mamba:
```
conda install -c conda-forge mamba
```
Use o Mamba intercambiavelmente com o Conda: A maioria dos comandos é a mesma, mas o Mamba não suporta o rollback de revisões de ambientes[2][4].

Dicas

Crie nomes descritivos para os ambientes: Ajuda no gerenciamento de múltiplos ambientes.
Ative o ambiente antes de instalar pacotes: Garante que os pacotes sejam instalados no ambiente correto.
Use canais específicos para pacotes: Garante que você obtenha os pacotes das fontes desejadas.
Evite conflitos de dependências: Instale todos os programas no ambiente ao mesmo tempo[5].