Conda チートシート - Anaconda コマンドラインパラメータ - 最も役立つ conda コマンド

condaコマンドのパラメータを忘れてしまった？

以下は、提供されたHugoページのコンテンツを英語から日本語に翻訳したものです。すべてのHugoショートコード、技術的な要素、構造は維持されています。

ここに以前にまとめたCondaのチートシートがあります。
このCondaチートシートは、環境、パッケージ、チャネルを管理する際に最も重要なコマンドとヒントを網羅しています私が役に立ったと思うもの。

眠っているConda

Condaのインストールと更新

新しい環境の作成:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Pythonバージョンを指定
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # 特定のパッケージで作成

環境のアクティベート:

conda activate my_env  # Windows、Linux、macOS
source activate my_env  # Linux、OS X（古い構文）

環境のクローン:

conda create --clone old_env --name new_env

環境の削除:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

リビジョンへの環境の復元:

conda install --rev 3  # リビジョン3にロールバック

インストールされたパッケージの一覧:

conda list
conda list -n my_env  # 特定の環境のパッケージを一覧

パッケージのインストール:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # 特定のチャネルからインストール
conda install package_name=1.2.3  # 特定のバージョンをインストール

パッケージのアンインストール:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # 特定の環境からアンインストール

パッケージの検索:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # 特定のチャネルで検索

チャネルの追加:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # 最高優先度で追加
conda config --append channels bioconda  # 最低優先度で追加

チャネルの優先度の設定:

conda config --set channel_priority strict

YAMLファイルへの環境のエクスポート:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # 明示的に要求されたパッケージのみをエクスポート

YAMLファイルからの環境のインポート:

conda env create --name my_env --file environment.yml

テキストファイルへの環境のエクスポート:
```
conda list --export > requirements.txt
```
テキストファイルからの環境のインポート:
```
conda create --name my_env --file requirements.txt
```

Conda設定の確認:

conda config --get
conda config --get channels

MambaはCondaよりも高速な代替手段ですが、特に環境リビジョンに関していくつかの制限があります。