Conda チートシート

condaコマンドのパラメータを忘れてしまった？

以下は、提供されたHugoページのコンテンツを英語から日本語に翻訳したものです。すべての技術的なフォーマット、構造、Hugo固有の要素は保持されています。

ここに私が以前にまとめたCondaのチートシートがあります。
このCondaチートシートは、環境、パッケージ、チャネルの管理に必要な最も重要なコマンドとヒントを網羅しています私が役に立ったもの。

Sleeping conda

Condaのインストールと更新

新しい環境の作成:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Pythonバージョンを指定
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # 特定のパッケージで作成

環境のアクティベート:

conda activate my_env  # Windows、Linux、macOS
source activate my_env  # Linux、OS X（古い構文）

環境のクローン:

conda create --clone old_env --name new_env

環境の削除:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

リビジョンへの環境の復元:

conda install --rev 3  # リビジョン3にロールバック

インストールされたパッケージのリスト:

conda list
conda list -n my_env  # 特定の環境のパッケージをリスト

パッケージのインストール:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # 特定のチャネルからインストール
conda install package_name=1.2.3  # 特定のバージョンをインストール

パッケージのアンインストール:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # 特定の環境からアンインストール

パッケージの検索:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # 特定のチャネルで検索

チャネルの追加:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # 最高優先度で追加
conda config --append channels bioconda  # 最低優先度で追加

チャネルの優先度の設定:

conda config --set channel_priority strict

YAMLファイルへの環境のエクスポート:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # 明示的に要求されたパッケージのみをエクスポート

YAMLファイルからの環境のインポート:

conda env create --name my_env --file environment.yml

テキストファイルへの環境のエクスポート:
```
conda list --export > requirements.txt
```
テキストファイルからの環境のインポート:
```
conda create --name my_env --file requirements.txt
```

Conda設定の確認:

conda config --get
conda config --get channels

MambaはCondaよりも高速な代替手段ですが、特に環境リビジョンに関してはいくつかの制限があります。