Conda Cheatsheet - Anaconda-kommandoradsparametrar - de mest användbara conda-kommandon

Glömt conda-kommandoparametrarna?

Sidinnehåll

Här är en Conda Cheatsheet som jag sammanställt för någon tid sedan… Denna Conda Cheatsheet täcker de mest grundläggande kommandona och tipsen för att hantera miljöer, paket och kanaler som jag har funnit användbara.

Sovande conda

Ta en titt på uv - Ny Python Pakethanterare, Projekt- och Miljöhanterare

Installera och Uppdatera Conda

Verifiera Conda Installation och Version:
```
conda info
```
Uppdatera Conda:
```
conda update conda
```
Uppdatera Anaconda Meta Paket:
```
conda update anaconda
```

Hantera Miljöer

Skapa en Ny Miljö:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Ange Python version
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # Skapa med specifika paket

Aktivera en Miljö:

conda activate my_env  # På Windows, Linux, macOS
source activate my_env  # På Linux, OS X (äldre syntax)

Deaktivera en Miljö:
```
conda deactivate
```
Lista Alla Miljöer:
```
conda env list
conda info --envs
```

Klona en Miljö:

conda create --clone old_env --name new_env

Byt Namn på en Miljö:
```
conda env rename -n old_env -d new_env
```

Radera en Miljö:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

Lista Revisioner av en Miljö:
```
conda list --revisions
```

Återställ Miljö till en Revision:

conda install --rev 3  # Återgå till revision 3

Hantera Paket

Lista Installerade Paket:

conda list
conda list -n my_env  # Lista paket i en specifik miljö

Installera ett Paket:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # Installera från en specifik kanal
conda install package_name=1.2.3  # Installera en specifik version

Uppdatera Alla Paket i en Miljö:
```
conda update --all
```

Avinstallera ett Paket:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # Avinstallera från en specifik miljö

Sök efter Paket:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # Sök i en specifik kanal

Arbeta med Kanaler

Lista Kanaler:
```
conda config --show channels
```

Lägg Till en Kanal:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # Lägg till med högsta prioritet
conda config --append channels bioconda  # Lägg till med lägsta prioritet

Ange Kanalprioritet:

conda config --set channel_priority strict

Exportera och Importera Miljöer

Exportera Miljö till YAML:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # Exportera endast explicit efterfrågade paket

Importera Miljö från YAML:

conda env create --name my_env --file environment.yml

Exportera Miljö till TEXT Fil:
```
conda list --export > requirements.txt
```

Importera Miljö från TEXT Fil:

conda create --name my_env --file requirements.txt

Ytterligare Kommandon

Få Hjälp för ett Kommando:
```
conda -h
conda install -h
```
Rensa Oanvända Filer:
```
conda clean --all
```

Undersök Conda Konfiguration:

conda config --get
conda config --get channels

Mamba (Valfritt)

Mamba är en snabbare alternativ till Conda, men det har vissa begränsningar, särskilt när det gäller miljörevisioner.

Installera Mamba:
```
conda install -c conda-forge mamba
```
Använd Mamba Bytbart med Conda: De flesta kommandon är desamma, men Mamba stöder inte att återgå till miljörevisioner[2][4].

Tips

Skapa Beskrivande Miljönamn: Hjälper till att hantera flera miljöer.
Aktivera Miljö Innan Installation av Paket: Säkerställer att paketen installeras i rätt miljö.
Använd Specifika Kanaler för Paket: Säkerställer att du får paketen från de önskade källorna.
Undvik Beroendekonflikter: Installera alla program i miljön samtidigt[5].